DI DATI
NGS
ANALISI
CLINICI
DI DATI
MOLECOLARI E
INTEGRAZIONE
LEARNING
DATA MINING
MACHINE
BIOSTATISTICA

Ci proponiamo come partner di bioinformatica in progetti di ricerca che mirano a utilizzare dati molecolari nel processo di diagnosi e cura personalizzata del paziente. Contattaci per una consulenza gratuita e senza impegno sul tuo progetto di ricerca.

Analisi di Dati NGS

I progetti di ricerca che usano le tecnologie NGS necessitano della definizione di un disegno sperimentale adeguato e di complesse procedure di analisi bioinformatiche per l’interpretazione dei dati.

Dal 2009 supportiamo la ricerca con l’analisi dei dati di sequenziamento per lo studio di patologie ereditarie, di tumori e per l’individuazione di nuovi target farmacologici. Le nostre analisi si adattano alla tecnologia di sequenziamento utilizzata (Illumina, Life Technologies e Roche).

enGenome offre report genetici che comprendono:
  • Amplicon Sequencing
  • Targeted Sequencing
  • Whole Exome Sequencing
  • Whole Genome Sequencing
  • RNA Sequencing
  • miRNA Sequencing
  • lncRNA Sequencing

La tua applicazione NGS non è tra quelle citate? Non preoccuparti, contattaci e troveremo la soluzione ad hoc per il tuo progetto.

Integrazione dei dati molecolari e clinici

L'integrazione delle diverse sorgenti di dati molecolari generati dalle tecnologie NGS richiede un'infrastruttura software adeguata per interrogare questa grande quantità di dati.

Il team di enGenome, in collaborazione con il Policlinico San Matteo ed il laboratorio della Rete Ematologica Lombarda (REL), ha sviluppato GeMoNe: una piattaforma bioinformatica in grado di analizzare in maniera congiunta una grande mole eterogenea di dati clinici e molecolari (es. mutazioni e espressioni geniche) generati dal sequenziamento di campioni biologici di pazienti affetti da neoplasie mieloidi.

Il framework di GeMoNe può essere utilizzato per analizzare dati molecolari di altre tipologie di tumore e si rivolge sia a ricercatori medici o biologi che desiderano analizzare i risultati dei loro esperimenti mediante un’interfaccia grafica semplice ed intuitiva, sia a ricercatori bioinformatici, che possono interrogare i dati con metodi di accesso programmatico (RESTful API).

Contattaci se sei interessato ad usare uno strumento simile nel tuo progetto di ricerca.

Biostatistica, Data mining e Machine learning

La complessità, il rumore, l’eterogeneità e la sparsità dei dati molecolari sono problematiche che possono fortemente influenzare i risultati di un lavoro di ricerca che mira ad identificare i fattori genetici e ambientali che possono essere utilizzati come indicatori diagnostici, prognostici e terapeutici per una patologia.

enGenome si avvale di esperti nel settore della biostatistica, del data mining e del machine learning e fornisce ai propri partner di ricerca il supporto necessario a comprendere e definire nuovi modelli dei dati, estrarre in maniera automatica le regole che spiegano particolari eventi ed utilizzarle nella classificazione di nuovi casi.

CONTATTACI

Scroll Up